Active Motif丨多重组学研究方法帮助您了解 HDACi 的作用机理

组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）是近些年来抗癌药物研究的一个热点方向。这一类化合物通过干扰组蛋白去乙酰化酶的功能，可促进癌症细胞的分化和凋亡，抑制肿瘤血管的形成。相对于传统细胞毒性药物，HDACi类药物安全性很高，可单独或与其它药物联合使用，也使它在治疗上有着广阔的前景。除癌症外，HDACi在临床上还可用于神经退行性疾病、炎症反应和心血管疾病等疾病的治疗。

HDACi处理会引起细胞内基因表达、染色质开放性、组蛋白乙酰化修饰和DNA甲基化等多方面的改变。近年来在对许多治疗靶点的研究中，以二代测序为基础的各类实验技术已经成为了解包括HDACi在内的药物作用机理的必要手段。多重的组学（omics）研究方法也越来越多的应用于HDACi的研究中来整合比对数据从而发现重要的基因和调控通路。

Active Motif 提供多种检测方式来研究基因表达、转录因子结合位点、组蛋白修饰、DNA 甲基化和染色质结构的改变。
 

HDAC assay 可用于培养细胞、动物组织、人的血细胞和人的病变组织等。
 

• Mod Spec^® 利用质谱检测组蛋白修饰来寻找HDACi处理后乙酰化水平增加的组蛋白赖氨酸残基。

 

• ATAC-Seq 检验患者的血细胞，HDACi 处理引起的染色质开放程度与对患者治疗效果正相关。
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• RRBS 用来寻找 HDACi 处理的细胞中 DNA 甲基化水平发生差异性改变的启动子。

• RNA-seq 将其它全基因组信息与表达组信息相结合，发现重要的基因和调控通路。

• ChIP-seq 用于研究肿瘤免疫模型中基因组范围内 HDACi 的结合位点和 H3K27ac 的修饰位点。HDACi 通过提高乙酰化水平，增加了作为抗原的检查点蛋白的基因表达，从而促进了检查点抑制剂的疗效。