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染色质免疫共沉淀 ChIP-Seq 技术服务
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上海艾跃(Active Motif)生物科技有限公司

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  • 联系人:

    Active Motif

  • 所在地区:

    上海 闵行区

  • 业务范围:

    试剂、实验室仪器 / 设备、技术服务、抗体

  • 经营模式:

    生产厂商 经销商

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Active Motif 新品上市 | 推出低细胞量 ChIP-Seq 试剂盒

1879 人阅读发布时间:2017-05-19 11:30

染色质免疫共沉淀(ChIP)是研究 DNA/蛋白质相互作用的有力工具。可以研究转录因子,调控蛋白,修饰组蛋白,染色质修饰酶等与 DNA 的特异性结合位点。

Active Motif 一直致力于为用户提供完整的 ChIP 实验解决方案。除标准 ChIP 为,也一直努力开发多种 ChIP 新技术,帮助用户解决不同的困难和实验需求。

标准的 ChIP-Seq 方法每个免疫沉淀反应需要使用百万级数量的细胞,通过大量的细胞样本获取全基因组范围的信息。然而对于某些细胞类型来说,获取百万级数量的细胞是难以实现的。对于许多细胞类型来说,细胞数量的限制是获得高质量 ChIP-Seq 数据的一大障碍。

与标准的 10 000 000 细胞作为起始样本量相比,使用少量细胞进行 ChIP-Seq 要困难很多。低细胞量 ChIP-Seq 往往会产生 ChIP 反应低信噪比,无效文库扩增和最终 ChIP-Seq 数据高重复率的问题。

为了克服这一障碍,Active Motif 研发团队利用多年 ChIP 产品研发的经验,经过不懈努力,成功推出针对少量样本的低细胞量 ChIP-Seq 试剂盒。不仅降低了起始样本数量的要求,同时也解决了低细胞 ChIP 引起的低信噪比,无效文库扩增及高重复率的问题。

产品亮点:

•    根据目标蛋白丰度不同,起始样本仅需 1 000~50 000 个细胞。

新闻图片1
 
•    完整的实验方案,提供包括染色质制备、免疫沉淀以及 NGS 文库构建所需的试剂。
•    优化的试剂有效降低背景,提高性噪比,得到更好的 peak calling 效果。
•    建库试剂含有分子识别码(MIDs),可区分 PCR 扩增片段和原始重复片段,保留更多的原始重复片段,得到更加准确的数据。

Low-Cell ChIP-Seq 数据

为了检测使用低细胞 ChIP-Seq 试剂盒的效果,我们通过实验比较了使用低细胞 ChIP-Seq 试剂盒得到的数据和 ENCODE 的数据。

结果表明,使用 5 000 个和 10 000 个细胞分别针对组蛋白修饰蛋白和 BRD4 蛋白进行 ChIP-Seq 都得到了与使用 20 000 000 个细胞得到的 ENCODE 数据质量相当的结果。

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使用 1 000~10 000 个细胞对多个靶点进行测试都得到了很好的效果。

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关于抗体

抗体质量是影响 ChIP 实验结果的重要因素,以下是 Active Motif 在 low-cell ChIP Kit 中验证过的抗体,使用这些抗体,效果更有保障哦。

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产品订购信息

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